Μικροβιολογία

Αρχές Κυτταρική Χημεία μικροοργανισμών:

• Χημική βάση των οργανισμών, ομάδες βιολογικών µακροµορίων, από τις απλές δομικές µμονάδες στα µακροµοριακά σύµπλοκα, οι χημικοί δεσμοί στα βιοµόρια.

Κυτταρικές Δομές μικροοργανισμών:

• Κυτταρική μεμβράνη και λειτουργία της (Αρχαία, Βακτήρια).
• Κυτταρικό τοίχωμα προκαρυωτών: Gram αρνητικά, Gram θετικά βακτήρια και Αρχαία, Εξωτερική μεμβράνη Gram αρνητικών βακτηρίων.
• Μετακίνηση μικροοργανισμών: Μαστίγια, Ολίσθηση, Χημειοτακτισμός, Φωτοτακτισμός, Κροσσοί, Στιβάδες S, Γλυκοκάλυκας, Έγκλειστα, Αεροκυστίδια, Ενδοσπόρια.
• Μεμβρανικά συστήματα μεταφοράς, εκκριτικά συστήματα Gram αρνητικών, Gram θετικών βακτηρίων.

Μοριακή Μικροβιολογία:

• Στάδια της ροής της γενετική πληροφορίας, δομή προκαρυωτικών γονιδιωμάτων, κεντρικό δόγμα της Μοριακής Βιολογίας.

• Βασικές αρχές Μοριακής Βιολογίας: Αντιγραφή, Μεταγραφή, Μετάφραση προκαρυωτικών οργανισμών,
• Ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης σε Βακτήρια και Αρχαία – RNA πολυμεράση, μεταγραφικοί παράγοντες,  δομή οπερονίων (arg, lac, mal, trp).

Eνέργεια και Μεταβολισμός των μικροοργανισμών:

• Βασικές αρχές ενεργητικής.
• Ενεργειακοί νόμοι του κυττάρου.
• Πρόσληψη χημικών ουσιών από το περιβάλλον.
• Mεμβρανικοί Μεταφορείς
• Οξειδοαναγωγή - Zύμωση και Aναπνοή.

Κυτταρική Ρύθμιση στα Βακτήρια και τα Αρχαία:

• Οι σημαντικότεροι τρόποι ρύθμισης σε Βακτήρια και Αρχαία: Μεταγραφική Ρύθμιση, Μέτα-Μεταγραφική Ρύθμιση, Μεταφραστική Pύθμιση, Μετα-μεταφραστική Ρύθμιση.
• Οπερόνια και ρυθμιζόνια.
• Μεταγραφικός έλεγχος στα Αρχαία
• Εξασθένιση – Attenuation.
• Αναδραστική αναστολή.
• Παγκόσμια ρύθμιση: Καταβολική αναστολή, Pυθμιστικά συστήματα δύο στοιχείων, Θερμικό πλήγμα, Kίνηση – χημειοτακτισμός.
• Αίσθηση μεγέθους πληθυσμού - Quorum Sensing.

Κυτταρική Διαίρεση στα Βακτήρια και τα Αρχαία:

• Κυτταρική Διχοτόμηση.
• Διαιρεσίσωμα.
• Αντιγραφή του γονιδιώματος στα ταχέως αναπτυσσόμενα κύτταρα.
• Αντιγραφόσωμα, αντιγραφή διπλής κατεύθυνσης.
• Δομες «Θ» η δομες Cairnes.
• Μετάλλαξη ή Μεταλλαγή, η Μοριακή βάση των μεταλλάξεων, μεταλλαξιγένεση
• Γονότυπος (ή γονιδιότυπος) και φαινότυπος.

Γενετικός ανασυνδυασμός:

• πρόσληψη εξωγενούς DNA
• Μηχανισμοί Γενετικής Ανταλλαγής: ο Μετασχηματισμός, η Μεταγωγή, η Σύζευξη.
• Mεταθετά στοιχεία.
• Γονιδιακή μεταφορά στα Αρχαία.
• Παρεμβολή CRISPR.

Αρχές Μοριακής φυλογένεσης μικροοργανισμών:

• Η εξελικτική προέλευση των μικροοργανισμών.
• Φυλογενετικά δένδρα.
• Μελέτης της Φυλογένεσης: ο βαθμός υβριδοποίησης DNA:DNA,

Αρχές Μικροβιακής συστηματικής:

• Η έννοια των ειδών στη Mικροβιολογία.
• φαινοτυπική ανάλυση.
• Γονιδιοτυπική ανάλυση.
• Ταξινομικές μέθοδοι στη συστηματική μικροβίων.
• Ονοματολογία Μικροοργανισμών.

Αρχές Γενετική Μηχανική και Βιοτεχνολογία:

• Περιοριστικά ένζυμα και διαχωρισμός νουκλεϊκών οξέων.
• Τροποποίηση: προστασία από τον περιορισμό.
• Υβριδοποίηση νουκλεϊκών οξέων.
• Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR), εφαρμογές της PCR
• Φορείς κλωνοποίησης, πλασμίδια, παλινδρομικοί φορείς, BACs, YACs
• Μοριακή Κλωνοποίηση.
• Προϊόντα από γενετικά τροποποιημένους μικροοργανισμούς, γενετικά τροποποιημένα εμβόλια (ανασυνδυασμένα εμβόλια).
• Εξόρυξη περιβαλλοντικών γονιδίων.
• Σχεδιασμός μεταβολικών μονοπατιών - metabolic engineering.

Αλληλεπιδράσεις ανθρώπου-μικροβίων:

• Αποικισμός.
• Φυσιολογική μικροχλωρίδα: Μικροχλωρίδα του δέρματος, Μικροχλωρίδα της στοματικής κοιλότητας, Μικροχλωρίδα του γαστρεντερικού σωλήνα.
• Αλλάζοντας τη φυσιολογική μικροχλωρίδα – προβιοτικά.
• Παθογένεση, Παθογονικότητα και μολυσματικότητα
• Μικροβιακές τοξίνες, ενδοτοξίνες, έξωτοξίνες.
• Βασικές αρχές ανοσολογίας, αντιδράσεις αντιγόνου-αντισώματος, συγκόλληση, φθορίζοντα αντισώματα, ELISA.
• Βασικές αρχές επιδημιολογίας.

Βασικές αρχές ιολογίας:

• Ιοί - Ταξινόμηση, Δομή (ιοσώματος, ιικού φακέλου), μέτρηση ιικού φορτίου, πολλαπλασιασμός ιών.
• Παραδείγματα ιών: Hepatitis C virus, Hepatitis B virus, Human immunodeficiency virus.
• Μοριακή Ιολογία.

Βασικές αρχές Μυκητολογίας:

• Μορφολογία μυκήτων και ωομυκήτων.
• Ταξινόμηση μυκήτων και ωομυκήτων.
• Γενετική μυκήτων & ωομυκήτων – Αναπαραγωγή.
• Μόλυνση των ξενιστών.