Μέθοδοι Λειτουργικής Ανάλυσης Βιολογικών Μακρομορίων

1. Συγκόλληση και κλωνοποίηση DNA (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-250  [Δ. Δοκιανάκη (ΕΔΙΠ) – ΕΥ: Γ. Γαρίνης]

Συγκόλληση πλασμιδιακού φορέα με ένθεμα. Συγκόλληση θραύσματος DNA με προεξέχοντα άκρα για τη δημιουργία θραυσμάτων διαφορικού μοριακού βάρους και χρήση του σαν μοριακό δείκτη. Ηλεκτροφόρηση σε πήκτωμα αγαρόζης. 

2. Μετασχηματισμός βακτηρίων (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-250  [Δ. Δοκιανάκη (ΕΔΙΠ) – ΕΥ: Γ. Γαρίνης]

Μετασχηματισμός δεκτικών βακτηρίων με την ligation και επιλογή σε τρυβλίο Petri με χρήση αντιβιοτικών. Χρήση UV για εντοπισμό έκφρασης της πράσινης φθορίζουσας πρωτεΐνης σε βακτήρια.

3. Λύση βακτηριακών κυττάρων που εκφράζουν αλκαλική φωσφατάση (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-305 [Δ. Δοκιανάκη (ΕΔΙΠ) – ΕΥ: Β. Μπουριώτης]

Λύση της βακτηριακής πάστας με λυσοζύμη και ανίχνευση της ενεργότητας του ενζύμου.

4. Καθαρισμός ενζύμου με χρωματογραφία ιοντοανταλλαγής (4 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-305 [Δ. Δοκιανάκη (ΕΔΙΠ) – ΕΥ: Β. Μπουριώτης]

Χρωματογραφία με Q-Sepharose και ανίχνευση της ενεργότητας του ενζύμου.

5. Ταυτοποίηση ενζύμου με ηλεκτροφόρηση σε πήκτωμα πολυακρυλαμίδης (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-305 [Δ. Δοκιανάκη (ΕΔΙΠ) – ΕΥ: Β. Μπουριώτης]

Ηλεκτροφόρηση σε πήκτωμα πολυακρυλαμίδης και ανάλυση αποτελεσμάτων.

6. Προσδιορισμός παραγόντων που επηρεάζουν την ενζυματική ενεργότητα φυτικών ιστών (3 ώρες) [Α. Παπαδάκη (ΕΔΙΠ) – ΕΥ: Κ. Κοτζαμπάσης]

Εκχύλιση ολικών πρωτεϊνών από φυτικούς ιστούς και μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την ενζυματική ενεργότητα της α-αμυλάσης (συγκέντρωση υποστρώματος και ενζύμου, χρόνος, pH, θερμοκρασία, παρουσία αναστολέων). 

7. Απομόνωση γενωμικού DNA από λευκά αιμοσφαίρια. (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-311 [Α. Παπαδάκη (ΕΔΙΠ) – ΕΥ: Γ. Γαρίνης]

Αιμοληψία στο ΠΑΓΝΗ από κάθε φοιτητή και επακόλουθη απομόνωση του γενωμικού DNA από το αίμα.

8. Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-250 [Μ. Δραμουντάνη (ΕΤΕΠ) – ΕΥ: Γ. Γαρίνης]

Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης και ηλεκτροφόρηση προϊόντων σε πήκτωμα αγαρόζης. Χρώση με βρωμιούχο αιθίδιο (EtBr) και φωτογράφηση.

9. Υβριδοποίηση DNA κατά Southern / Microarrays  (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-311 [Α. Παπαδάκη (ΕΔΙΠ) – ΕΥ: Γ. Γαρίνης]

Ανάλυση και ανάπτυξη των τεχνικών.

10. Γονοτύπηση (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-311 [Μ. Δραμουντάνη (ΕΤΕΠ) – ΕΥ: Γ. Γαρίνης]

Ανάλυση γονοτύπων με 2 διαφορετικούς μικροδορυφορικούς τόπους. Ανάλυση χαρακτηριστικών γενετικών δεικτών και μικροδορυφόρων. Ανάλυση πειραματικής διαδικασίας, ανάλυση γονοτύπων, συχνότητα άλληλομόρφων, ποσοστό ετεροζυγωτίας γενετικού δείκτη, αξιολόγηση γενετικών δεικτών, ασκήσεις.

11. Ανοσολογικές Τεχνικές (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-301 [Ε. Κουϊμτζόγλου (ΕΔΙΠ)– ΕΥ: Ε. Αθανασάκη]

Δομή και τρόπος δράσης των ανοσοσφαιρινών IgG/Πειραματική διαδικασία καθίζησης σε υγρή Φάση.

12. Ανοσολογικές Τεχνικές (3 ώρες) αντιστοιχεί σε άσκηση του ΒΙΟΛ-307 [Ε. Κουϊμτζόγλου (ΕΔΙΠ)– ΕΥ: Ε. Αθανασάκη]

Ανοσοποιητικός προσδιορισμός συνδεδεμένος με ένζυμο (ELISA). Παρουσίαση 3 μεθόδων ELISA (συναγωνιστική, sandwich, έμμεση). Εικονικό πείραμα με τη μέθοδο ELISA.